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中新網成都8月15日電 (記者 賀劭清)記者15日從中科院成都生物研究所獲悉，中科院成都生物研究所植物多樣性研究團隊利用Illumina測序技術分別研究了極小種群之一的巴郎山杓蘭和對葉杓蘭的葉綠體基因組特征，并基于葉綠體基因組數據重建了蘭科植物5個亞科中的47個物種的系統發育樹，為闡明杓蘭屬和蘭科植物的系統發育關系和分類關系作出了重要貢獻。
據了解，蘭科是被子植物中最大的兩個科之一，由大約880個屬和27000個種組成，占所有維管植物物種的8%。蘭科杓蘭屬植物具有獨特的彩色唇瓣，具有極高的觀賞和經濟價值，主要分布在北半球的溫帶地區。在野外，由于自然棲息地的退化和人為過度采集，該屬的許多物種已經變得非常稀有和極度瀕危。截至目前該屬的全部物種均被列入瀕危野生動植物國際貿易公約。
中科院成都生物研究所植物多樣性研究團隊首次報道了巴郎山杓蘭和對葉杓蘭的葉綠體基因組特征，兩個基因組長度為162,773-207,142 bp，包含128-130個基因，包括82-84個蛋白編碼基因，38個tRNA基因和8個rRNA基因；共定義了2,192個簡單序列重復(SSRs)，786個長重復序列(LSRs)和7,929個可變位點(High Variable Loci)；確定了12個高度多態的基因座(Pi>0.09)，適合于未來推斷杓蘭屬物種的系統發育。
此外，研究團隊還揭示了該屬葉綠體基因組顯著擴增的機制，并討論了IR區的擴增導致SSC區的基因假基因化或丟失。同時，基于葉綠體基因組數據構建的系統發育樹為解決蘭科植物的系統發育關系提供了新的見解。
相關研究成果近期以《Comparative chloroplast genomics of seven endangered Cypripedium species and phylogenetic relationships of Orchidaceae》為題發表在《Frontiers in Plant Science》。中國科學院成都生物所和重慶師范大學聯合培養的碩士研究生張君議和中國科學院成都生物研究所廖敏博士為論文的共同第一作者，徐波副研究員為論文的通訊作者。相關研究得到了中國國家重點研發計劃、第二次青藏高原科學考察計劃和四川省野生植物共享與服務平臺的資助。(完)
標簽： 中科院成都生物研究所
