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科技日報北京4月3日電 （記者張夢然）美國北卡羅來納州立大學開發(fā)出全球首個用于植物病原體的新在線工具，將幫助研究人員識別、檢測和監(jiān)測疫霉屬物種，這些“植物破壞者”病害造成了1840年代毀滅性的愛爾蘭馬鈴薯饑荒，以及目前仍在美國西海岸蔓延的橡樹群體性死亡。研究發(fā)表在最新一期《公共科學圖書館·綜合》上。
疫霉屬第一個物種于1876年得到描述和命名。疫霉存在于空氣、土壤和水中，可導致糧食作物、觀賞植物和樹木患病。自2000年以來，研究人員已經(jīng)確定了大約150種新的疫霉屬物種。這是一個異常大量的植物病原體物種，許多疫霉屬物種具有廣泛的宿主范圍，因此它們可在更廣泛的區(qū)域“移動”。
此次構建的“生命之樹”提供了關于超過192個正式描述的物種中的大量信息，包括它們的進化歷史和群體內的關系，以及30多個其他非正式描述的分類單元。它還包括來自每個物種的遺傳藍圖或基因組上多個位置的基因序列數(shù)據(jù)。其他重要數(shù)據(jù)包括每個物種的全球位置、承載病原體的植物以及病原體在其植物宿主之中或之上的位置。
患病的植物就如同“沉默的病人”，但這一基于樹的比對選擇器（T-BAS）工具包，將所有已知的疫霉屬物種放入活的“生命之樹”中，還可將新出現(xiàn)的威脅物種放入開放獲取樹中，并查看哪些群體正在擴大和進化。新工具將使研究人員能夠實時更新植物病害信息。
研究人員表示，預防疾病暴發(fā)的真正關鍵是在暴發(fā)之前抓住信號。T-BAS可用作疾病監(jiān)測和確定可能出現(xiàn)的下一個新譜系的工具。
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